בד המסנן המשמש במסכות רפואיות סופג בעיקר חיידקים ווירוסים, וחוסם פתוגנים. בשכבת הסינון הצפופה משתמשים בחומר פילטר N95, שיכול לסנן חלקיקים ולחסום ביעילות מריחת עף, דם, נוזלי גוף והפרשות. רצועת הראש של המסכה הרפואית היא שתי רצועות ארוכות העוברות דרך החורים בשני צידי המסכה. האף מהודק במרכז החלק העליון של שכבת המסנן ומונח בין השכבה הצפופה לשכבת המסנן. החומר הוא מתכת מורכבת או מתכת-פלסטיק, שיש להם גם פלסטיות וגם חוזק מסוים, וקל ללבישה כאשר האף אטום. ניתן לומר כי מסכות רפואיות הן אמצעי הגנה להגנה על הזיהום ההדדי בין הצוות הרפואי לחולים. לכן יעילות סינון החיידקים חייבת להיות גבוהה מ- 95% בהתאם לדרישות הלאומיות, שזה תפקיד חשוב של מסכות רפואיות.
